Ko te whakamatautau methylation DNA me nga waea atamai mo te tirotiro wawe i nga pukupuku me te tirotiro i te reukemia me te tika o te 90.0%!

Ko te kitenga moata o te mate pukupuku i runga i te koiora wai he huarahi hou mo te kimi mate pukupuku me te tātaritanga i whakaarohia e te US National Cancer Institute i roto i nga tau tata nei, me te whai ki te kite i nga mate pukupuku moata, tae noa ki nga reanga mate pukupuku.Kua whakamahia whānuitia hei tohu koiora hou mo te tātaritanga moata o nga momo mate kino, tae atu ki te mate pukupuku o te huhu, te puku o te kopu, te glioma me nga pukupuku gynecological.

Ko te putanga mai o nga papa hei tautuhi i nga tohu koiora o te whenua methylation (Methylscape) ka kaha ki te whakapai ake i te tirotiro moata mo te mate pukupuku, me te tuu i nga turoro ki te waahi ka taea te rongoa.

Ina tata nei, kua whakawhanakehia e nga kairangahau tetahi papaaaaaro ngawari me te tika mo te rapunga whenua methylation i runga i nga nanoparticles koura kua whakapaipaihia ki te cysteamine (Cyst/AuNPs) kua honoa me te kaikoo-a-rorohiko e taea ai te tirotiro wawe mo te maha o nga momo pukupuku.Ka taea te tirotiro moata mo te reukemia i roto i te 15 meneti i muri i te tangohanga DNA mai i te tauira toto, me te tika o te 90.0%.Ko te taitara o te tuhinga ko te kitenga tere o te DNA mate pukupuku i roto i te toto o te tangata ma te whakamahi i nga AuNP kua mau ki te cysteamine me te waea atamai ako miihini.

Whakaahua 1. Ka taea te mahi i tetahi papahanga ngawari me te tere mo te tirotiro mate pukupuku ma nga waahanga Cyst/AuNPs i roto i nga waahanga e rua.

Ka whakaatuhia tenei i te Whakaahua 1. Tuatahi, i whakamahia he wairewa wai hei whakakore i nga maramara DNA.Ka taapirihia nga Cyst/AuNPs ki te otinga whakauru.He rereke nga ahuatanga o te methylation DNA noa me te kino kino, ka puta mai he maramara DNA me nga tauira huinga-whaiaro rereke.Ko te DNA noa ka whakahiato noa, ka mutu ka whakahiato i te Cyst/AuNPs, ka puta ko te ahua o te Cyst/AuNPs he whero-whero, kia kitea te huringa o te tae mai i te whero ki te papura ma te kanohi tahanga.Engari, ko te tohu methylation ahurei o te DNA mate pukupuku e arai ana ki te hanga i nga tautau nui o nga kongakonga DNA.

I tangohia nga whakaahua o nga pereti 96-puna ma te whakamahi i te kamera atamai.Ko te DNA mate pukupuku i inehia e te waea atamai e mau ana ki te ako miihini ka whakatauritea ki nga tikanga-a-tuhinga-a-ira.

Te tirotiro mate pukupuku i roto i nga tauira toto tuturu

Hei whakawhanui i te whaipainga o te papaaho, ka tono nga kaitirotiro i tetahi pukoro i pai te wehewehe i waenga i te DNA noa me te mate pukupuku i roto i nga tauira toto tuturu.Ko nga tauira methylation i nga waahi CpG e whakahaere ana i nga whakaaturanga ira.Tata ki nga momo mate pukupuku katoa, ka kitea nga huringa i roto i te methylation DNA me te whakaatu i nga ira e whakatairanga ana i te tumourigenesis kua kitea he rereke.

Hei tauira mo etahi atu mate pukupuku e pa ana ki te DNA methylation, i whakamahia e nga kairangahau nga tauira toto mai i nga turoro reukemia me nga mana hauora ki te tirotiro i te whai huatanga o te whenua methylation ki te wehewehe i nga mate pukupuku leukaemic.Ko tenei tohu koiora whenua methylation ehara i te mea he pai ake nga tikanga tirotiro reukemia tere o naianei, engari e whakaatu ana i te kaha ki te toro atu ki te kite wawe i nga momo mate pukupuku ma te whakamahi i tenei whakamatautau ngawari me te ngawari.

I tātarihia te DNA mai i nga tauira toto mai i nga turoro reukemia 31 me nga tangata hauora 12.e whakaatuhia ana i roto i te pouaka pouaka i te Whakaahua 2a, he iti ake te whakaurunga o nga tauira mate pukupuku (ΔA650/525) i te DNA mai i nga tauira noa.Ko te nuinga o tenei na te kaha ake o te hydrophobicity e arahi ana ki te whakahiatotanga o te DNA mate pukupuku, i aukati i te whakahiatotanga o Cyst/AuNPs.Ko te mutunga, ko enei nanoparticles i tino marara i roto i nga papa o waho o nga kohinga mate pukupuku, i puta mai he rereke rereke o te Cyst / AuNPs kua whakauruhia ki runga i nga kohinga DNA noa me te mate pukupuku.I hangaia nga pihi ROC ma te rereke i te paepae mai i te uara iti o te ΔA650/525 ki te uara teitei.

Whakaahua 2.(a) Ko nga uara urunga tata o nga wairewa katoo/AuNPs e whakaatu ana i te noho o te DNA noa (puru) me te mate pukupuku (whero) i raro i nga tikanga pai

(DA650/525) o nga waahi pouaka;(b) te tātari ROC me te arotake i nga whakamatautau mate.(c) Matrix rangirua mo te tātaritanga o nga turoro noa me te mate pukupuku.(d) Te tairongo, te motuhake, te uara matapae pai (PPV), te uara matapae kino (NPV) me te tika o te tikanga kua whakawhanakehia.

Ka rite ki te whakaatu i te Whakaahua 2b, ko te waahi i raro i te arai ROC (AUC = 0.9274) i whiwhihia mo te puoro kua whakawhanakehia i whakaatu i te kaha me te motuhake.Ka kitea mai i te waahi pouaka, ko te waahi iti rawa e tohu ana i te roopu DNA noa kaore i tino wehea mai i te waahi teitei e tohu ana i te roopu DNA mate pukupuku;no reira, i whakamahia te regression logistic ki te wehewehe i waenga i nga roopu noa me nga roopu mate pukupuku.I runga i te huinga o nga taurangi motuhake, ka whakatauhia e ia te tupono ka puta mai tetahi huihuinga, penei i te mate pukupuku, i te roopu noa ranei.Ko te taurangi ti'aturi kei waenga i te 0 me te 1. No reira he tūponotanga te hua.I whakatauhia e matou te tupono o te tohu mate pukupuku (P) i runga i te ΔA650/525 e whai ake nei.

kei hea b=5.3533,w1=-6.965.Mo te whakarōpūtanga tauira, he iti iho i te 0.5 te tohu he tauira noa, ko te 0.5 teitei ake ranei ka tohu he tauira mate pukupuku.Ko te ahua 2c e whakaatu ana i te matrix rangirua i puta mai i te whakamana-whakawhiti-whakatika, i whakamahia hei whakamana i te pumau o te tikanga whakarōpūtanga.Ko te ahua 2d e whakarāpopoto ana i te arotakenga whakamātautau tātaritanga o te tikanga, tae atu ki te tairongo, te motuhake, te uara matapae pai (PPV) me te uara matapae kino (NPV).

Ko nga kaikoiora e pa ana ki te waea atamai

Hei whakangawari ake i nga whakamatautau tauira me te kore e whakamahi i te spectrophotometers, i whakamahia e nga kairangahau te mohiotanga horihori (AI) ki te whakamaori i te tae o te otinga me te wehewehe i waenga i nga tangata noa me nga tangata mate pukupuku.Na tenei, i whakamahia te tirohanga rorohiko ki te whakamaori i te tae o te otinga Cyst/AuNPs ki te DNA noa (papura), te DNA mate pukupuku ranei (whero) ma te whakamahi i nga whakaahua o nga pereti 96-puna i tangohia ma te kaamera waea pūkoro.Ka taea e te mohio horihori te whakaiti i nga utu me te whakapai ake i te urunga ki te whakamaori i te tae o nga otinga nanoparticle, me te kore e whakamahi i nga taputapu waea atamai.Ka mutu, e rua nga tauira ako miihini, tae atu ki te Random Forest (RF) me te Tautoko Vector Machine (SVM) i whakangungua ki te hanga i nga tauira.Ko nga tauira RF me te SVM i tika te whakariterite i nga tauira hei pai me te kino me te tika o te 90.0%.E tohu ana tenei ka taea te whakamahi i te matauranga mohio i roto i te koiora-a-waea pukoro.

Whakaahua 3.(a) Te karaehe whainga o te otinga i tuhia i te wa e whakareri ana te tauira mo te taahiraa tango atahanga.(b) He tauira atahanga i tangohia i te wa o te tango whakaahua.(c) Te kaha o te tae o te wairewa cyst/AuNPs i ia puna o te pereti 96-puna i tangohia mai i te ahua (b).

Ma te whakamahi i te Cyst/AuNPs, kua angitu nga kairangahau ki te hanga i tetahi papaatanga ngawari mo te rapunga whenua methylation me te pukoro e kaha ana ki te wehe i te DNA noa mai i te DNA mate pukupuku i te wa e whakamahi ana i nga tauira toto tuturu mo te tirotiro reukemia.I whakaatuhia e te pukoro kua whakawhanakehia ko te DNA i tangohia mai i nga tauira toto tuuturu i kaha ki te kite i te iti o te DNA mate pukupuku (3nM) i roto i nga turoro reukemia i roto i te 15 meneti, me te whakaatu i te tika o te 95.3%.Hei whakangwari ake i nga whakamatautau tauira ma te whakakore i te hiahia mo te spectrophotometer, i whakamahia te ako miihini ki te whakamaori i te tae o te otinga me te wehewehe i waenga i nga tangata noa me te hunga mate pukupuku e whakamahi ana i te whakaahua waea pukoro, me te tika i taea ki te 90.0%.

Tohutoro: DOI: 10.1039/d2ra05725e