Mahinga e wha nga whakamatautau whakakaha waikawa karihi hei tautuhi i te SARS-CoV-2 i Etiopia

Mauruuru koe mo te toro ki Nature.com. Kei te whakamahi koe i tetahi putanga tirotiro me te tautoko CSS iti. Mo te wheako pai rawa atu, e taunaki ana matou me whakamahi koe i tetahi kaitirotiro kua whakahoutia (me monohia ranei te Aratau Hototahi ki Internet Explorer). I tua atu, hei whakarite i te tautoko tonu, ka whakaatuhia e matou te waahi kaore he momo me te JavaScript.
Ka whakaatu i te carousel o nga kiriata e toru i te wa kotahi. Whakamahia nga paatene o mua me te Panuku ki te neke i roto i nga kiriata e toru i te wa kotahi, ka whakamahi ranei i nga patene rereti i te mutunga ki te neke i roto i nga kiriata e toru i te wa kotahi.
Mai i te pakarutanga mai o te mate coronavirus (COVID-19) 2019, he maha nga whakamatautau whakakaha waikawa karihi arumoni (NAATs) kua whakawhanakehia puta noa i te ao, kua noho hei whakamatautau paerewa. Ahakoa he maha nga whakamatautau i tere whakawhanakehia me te tono ki nga whakamatautau taiwhanga taiwhanga, kaore ano kia arotakehia te mahinga o enei whakamatautau i roto i nga momo waahanga. No reira, ko tenei rangahau i whai ki te arotake i nga mahi a Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI, me te Sansure Biotech ma te whakamahi i te Composite Reference Standard (CRS). I whakahaerehia te rangahau i te Ethiopian Public Health Institute (EPHI) mai i te 1 ki te 30 Hakihea 2020. 164 nga tauira nasopharyngeal i tangohia ma te whakamahi i te kete QIAamp RNA mini me te punaha whakarite tauira DNA Abbott. Mai i nga tauira 164, 59.1% he pai me te 40.9% he kino mo te CRS. He iti rawa te pai o te Sansure Biotech ki te CRS (p <0.05). He iti rawa te pai o te Sansure Biotech ki te CRS (p <0.05). Положительные результати Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению ki CRS (p < 0,05). Ko nga hua pai a Sansure Biotech i tino iti ake ki te CRS (p <0.05).与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p < 0.05）。与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p < 0.05）。 У Sansure Biotech было значительно меньше положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). He iti ake nga hua pai a Sansure Biotech ki te CRS (p <0.05).Ko te whakaaetanga whānui o nga tātaritanga e wha ko te 96.3–100% ka whakaritea ki te CRS. I tua atu i te iti o te reeti pai o te Sansure Biotech assay, ko te mahinga o nga whakamatautau e wha i tata rite. No reira, ko te whakamatautau a Sansure Biotech [Rangahau anake (RUO)] me whai whakamanatanga taapiri mo tana whakamahinga ki Etiopia. Ka mutu, me whakaaro etahi atu rangahau hei arotake i nga whakamatautau me nga kereme a te kaiwhakanao.
Ko nga whakamatautau taiwhanga tetahi waahanga o te Mahere Rautaki a te Whakahaere Hauora o te Ao (WHO) mo te mate Coronavirus 2019 (COVID-19) Whakaritea me te Whakautu (SPRP). Ko te tohutohu a WHO me hanga e nga whenua te kaha taiwhanga ki te whakapai ake i te whakarite, te whakahaere take tika, te mataara me te whakautu tere ki nga wero hauora a te iwi. E tohu ana tenei ko te mahi a te taiwhanga te mea matua ki te tohu i te mate me te mate urutaru o nga kaihopu hopuhopu ka puta ake me te whakahaere i te horapa.
Ko te tātaritanga o te COVID-19 e hiahia ana ki nga korero mate uruta me te rongoa, nga tohu whaiaro/tohu, me nga raraunga irirangi me te taiwhanga2. Mai i te purongo o te mate COVID-19 i Wuhan, Haina, he maha nga whakamatautau whakakaha waikawa karihi arumoni (NAAT) kua whakawhanakehia puta noa i te ao. Kua whakamahia te tauhohenga mekameka polymerase whakamuri whakamuri (rRT-PCR) hei tikanga mo te taiwhanga taiwhanga mo te mate mate manawa whakapeka 2 (SARS-CoV-2)3. Ko te kitenga rapoi o te SARS-CoV-2 i te nuinga o te waa i runga i te N (nucleocapsid pūmua ira), E (kopaki pūmua ira), me te RdRp (RNA-whakawhirinaki RNA polymerase ira) i ORF1a/b (tuwhera anga panui 1a/b) . ira) rohe i tautuhia mai i te ira ira tangata. E kiia ana ko ratou nga rohe tino tiaki i kitea i roto i nga momo ira tangata mo te mohiotanga huaketo4. I roto i enei ira, ko nga ira RdRp me te E he teitei te tairongo tātaritanga, ko te ira N he iti te tairongo tātari5.
Ka rereke pea te mahinga o nga whakamatautau PCR i runga i nga ahuatanga rereke penei: nga reagents tangohanga, reagents whakakaha/kitenga, tikanga tangohanga, te kounga o te miihini PCR me etahi atu taputapu. Mai i te Paenga-whāwhā 2020, neke atu i te 48 nga momo taputapu tātaritanga mai i nga whenua e iwa kua whakawhiwhia ki te Whakaaetanga Whakamahi ohorere (EUA) mo nga tātaritanga COVID-196. I Etiopia, neke atu i te 14 nga papaapapa PCR tuuturu e whakamahia ana mo te kitenga PCR o SARS-CoV-2 i nga whare hauora whanui 26, tae atu ki te ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 me Quant-studio7. Hei taapiri, he maha nga kete whakamatautau PCR e waatea ana, penei i te whakamatautau Daan Gene, te whakamatautau Abbott SARS-CoV-2, te whakamatautau Sansure Biotech, me te whakamatautau SARS-CoV-2 BGI. Ahakoa he tino tairongo te rRT-PCR, ka kii etahi o nga turoro me COVID-19 i nga hua kino kino na te iti o nga kape o te waikawa ribonucleic viral (RNA) i roto i nga tauira na te he o te kohinga, te kawe, te rokiroki me te whakahaere, me nga whakamatautau taiwhanga. nga tikanga me nga mahi a nga kaimahi8. Hei taapiri, ko te tauira, te whakahaere pohehe ranei, te whakatakotoranga o te paepae huringa (Ct), me te tauhohenga whiti me etahi atu waikawa karihi pathogenic, ko te SARS-CoV-2 RNA kore ranei, ka puta he hua pai i roto i nga whakamatautau rRT-PCR9. No reira, he maarama ka taea e nga whakamatautau PCR te tautuhi i nga kaikawe i nga kongakonga ira, na te mea kaore e taea te wehewehe i waenga i nga ira hohe tino kaha, na reira ka taea e nga whakamatautau te tautuhi i nga kaikawe kaikawe kaore nga turoro10. Na reira, he mea nui ki te aromatawai i nga mahi tātaritanga ma te whakamahi i nga tikanga paerewa i roto i to maatau waahi. Ahakoa he maha nga reagents NAAT e waatea ana i te Etiopian Public Health Institute (EPHI) me puta noa i te motu, kaore ano kia puta he arotake whakatairite mo o raatau whai huatanga. No reira, ko tenei rangahau i whai ki te arotake i nga mahi whakatairite o nga kete e waatea ana mo te rapunga o SARS-CoV-2 ma te rRT-PCR ma te whakamahi i nga tauira haumanu.
He 164 nga kaiuru e whakapaetia ana ko COVID-19 i uru ki tenei rangahau. Ko te nuinga o nga tauira i ahu mai i nga pokapū maimoatanga (118/164 = 72%), ko te toenga 46 (28%) i uru mai i nga pokapū maimoatanga kore. I waenga i nga kaiuru kare i rongoa i te pokapu, 15 (9.1%) he keehi kua whakapaehia e te haumanu me te 31 (18.9%) he hoapaki o nga keehi kua whakapumautia. E iwa tekau ma toru (56.7%) nga kaiuru he tane, ko te tau toharite (± SD) o nga kaiuru he 31.10 (± 11.82) tau.
I roto i tenei rangahau, i whakatauhia nga reeti pai me te kino o nga whakamatautau e wha mo COVID-19. No reira, ko nga reeti pai o te whakamatautau Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene 2019-nCoV assay, SARS-CoV-2 BGI assay, me Sansure Biotech 2019-nCoV assay he 59.1%, 58.5%, 57.9% me te 55.5% ia. . Ko te pai me te kino o nga tohu tohutoro hiato (CRS) he 97 (59.1%) me te 67 (40.9%) (Ripanga 1). I roto i tenei rangahau, ko te whakamaramatanga o te CRS i ahu mai i runga i te ture "tetahi pai", i roto i nga hua whakamatautau e wha, e rua, neke atu ranei nga hua whakamatautau i puta he rite nga hua ka kiia he pai, he kino ranei.
I roto i tenei rangahau, i kitea e matou he kirimana pahekeheke kino (NPA) o 100% (95% CI 94.6-100) mo nga tātaritanga katoa i whakaritea ki te CRS. I whakaatuhia e te tātaritanga Sansure Biotechnology he iti noa iho te PPA o 93.8% (95% CI 87.2-97.1) me te tātaritanga Daan Gene 2019-nCoV he whakaaetanga katoa o 99.4% (95% CI 96.6-99.9). He rereke, ko te whakaaetanga whanui i waenga i te whakamatautau SARS-CoV-2 BGI me te whakamatautau Sansure Biotech 2019-nCoV he 98.8% me te 96.3% (Ripanga 2).
Ko te whakarea kappa a Cohen mo te whakaaetanga i waenga i te CRS me te Abbott SARS-CoV-2 i tino rite nga hua (K = 1.00). Waihoki, ko nga uara kappa a Cohen i kitea e Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI, me Sansure Biotech 2019-nCoV he tino rite ki te CRS (K ≥ 0.925). I roto i tenei tātaritanga whakatairite, ko te whakamatautau chi-square (whakamatautau McNemar) i whakaatu he tino rerekee nga hua whakamatautau a Sansure Biotech 2019-nCoV i nga hua CRS (p = 0.031) (Ripanga 2).
Ka rite ki te whakaatu i te Fig.1 ko te ōrau o te uara Ct iti rawa (<20 Ct) o Abbott SARS-CoV-2 whakamātautau (whakakotahitia te RdRp me te ira N) ko te 87.6% me te uara ORF1a/b ira Ct o Sansure Biotech 2019-nCoV i whakaatu ko te paheketanga o te iti. Ko te uara Ct (< 20 Ct) he 50.3% me te uara Ct teitei (36–40 Ct) ko 3.2%. 1 ko te ōrau o te uara Ct iti rawa (<20 Ct) o Abbott SARS-CoV-2 whakamātautau (whakakotahitia te RdRp me te ira N) ko te 87.6% me te uara ORF1a/b ira Ct o Sansure Biotech 2019-nCoV i whakaatu ko te paheketanga o te iti. Ko te uara Ct (< 20 Ct) he 50.3% me te uara Ct teitei (36–40 Ct) ko 3.2%.Ka rite ki te whakaatu i te Fig.1, процент наименьшего значения Ct (< 20 Ct) анализа Abbott SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp и N) составил 87,6%, а гена RF зt. анализа Sansure Biotech 2019-nCoV показало что процент низкого значения Ct (<20 Ct) составлял 50,3%, a высокое значение Ct (36 %. 1, ko te ōrau o te uara Ct iti rawa (<20 Ct) tātaritanga o Abbott SARS-CoV-2 (whakakotahi ira RdRp me N) he 87.6%, me te uara Ct o ORF1a/b tātari ira o Sansure Biotech 2019-nCoV i whakaatu ko te paheketanga o te uara Ct iti (<20 Ct) he 50.3%, me te uara teitei Ct (36–40 Ct) e 3.2%.如图1 所示，Abbott SARS-CoV-2 检测（结合RdRp 和N 基因）的最低Ct 值百分比（< 20 Ct8）丽 9 Ct.Vn 6%检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct 值(< 20 Ct) 的百分比为50.3%，高Ct 值(36–40 Ct) 的百分比. E whakaatu ana i te Whakaahua 1, ko te iti rawa o te uara o te uara Ct (<20 Ct) o te whakamatautau Abbott SARS-CoV-2 (te whakakotahitanga o te ira RdRp me te ira N) he 87.6%, ko te uara ORF1a/b ira Ct o te whakamatautau Sansure Biotech 2019-nCoV whakaatu iti Ct(< 20 Ct) 的 ōrau he 50.3%, 高Ct值(36–40 Ct) 的 ōrau he 3.2%. Как показано на рисунке 1, анализ Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) имел самое низкое процентное знач (<ение клет знач) 87,6%, he значение Ct гена ORF1a/b в исследовании Sansure Biotech 2019- Анализ nCoV показал низкий Ct. E whakaatu ana i te Whakaahua 1, ko te whakamatautau Abbott SARS-CoV-2 (te whakakotahi i nga ira RdRp me N) he iti rawa te paheketanga o te uara Ct (<20 Ct) i te 87.6%, ko te uara Ct o te ira ORF1a/b i roto i te Sansure. Te rangahau Biotech 2019 - I whakaatuhia e te tātaritanga o nCoV he iti Ct. Процент значений (< 20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких значений Ct (36–40 Ct) составил 3,2%. Ko te paheketanga o nga uara (<20 Ct) he 50.3%, ko te paheketanga o nga uara Ct teitei (36–40 Ct) he 3.2%.Ko te whakamatautau Abbott SARS-CoV-2 B i tuhia nga uara Ct i runga ake i te 30. I tetahi atu taha, i runga i te BGI SARS-CoV-2 assay ORF1a/b ira he uara Ct teitei (> 36 Ct) te ōrau he 4% (Fig. 1). I tetahi atu taha, i runga i te BGI SARS-CoV-2 assay ORF1a/b ira he uara Ct teitei (> 36 Ct) te ōrau he 4% (Fig. 1). С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 ген ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct), процент которого составл. 4%). I tetahi atu taha, i roto i te tātaritanga o te ira BGI SARS-CoV-2 ORF1a/b he uara Ct teitei (> 36 Ct), ko te paheketanga ko te 4% (Fig. 1).另一方面，在BGI SARS-CoV-2 检测中，ORF1a/b 基因具有高Ct 值（> 36 Ct）的百分比为4%（图 I tetahi atu taha, i te kitenga o te BGI SARS-CoV-2, ko te ōrau o te ira ORF1a/b me te uara Ct teitei (>36 Ct) he 4% (Whakaahua 1). С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 процент генов ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) составил 4% (hei tauira 1). I tetahi atu taha, i roto i te tātaritanga BGI SARS-CoV-2, ko te paheketanga o nga ira ORF1a/b me nga uara Ct teitei (>36 Ct) he 4% (Fig. 1).
I tenei rangahau, 164 nga tauira nasopharyngeal i tangohia e matou. Mo nga momo whakamatautau katoa, i mahia te wehe me te whakanui i te RNA ma te whakamahi i nga tikanga me nga kete kua tohua e nga kaihanga.
I whakaatuhia e tenei rangahau ko te whakamatautau a Abbott mo te SARS-CoV-2 he rite tonu te mahi kitenga ki te CRS, me te 100% pai, kino, me te whakakotahitanga katoa. Ko te whakaaetanga kappa a Cohen he 1.00, e tohu ana i te whakaaetanga katoa me CRS. He rangahau ano na te Whare Wananga o Washington i te US i kitea ko te tino aro nui me te motuhake o te whakamatautau Abbott mo SARS-CoV-2 he 93% me te 100%, ka whakatauritea ki te whakamatautau taiwhanga (LDA) o te CDC . 11. Ko te punaha rapunga Abbott SARS-CoV-2 i ahu mai i te kitenga kotahitanga o nga ira N me te RdRp, na te mea he tairongo ake nga ira e rua, me te whakaiti i nga kino kino12. I kitea ano e te rangahau i Vienna, Austria ko te nui o nga pukapuka tangohanga tauira me nga pukapuka eluent kitea i whakaiti i nga paanga waimeha me te kaha ake o te rapunga13. No reira, ko te whakataetae tino pai a Abbott mo te whakamatautau SARS-CoV-2 ka taea te hono atu ki tetahi punaha rapunga papaaho ka kitea i te wa kotahi nga ira whakakotahitanga, ka tango i te maha o nga tauira (0.5 ml), me te whakamahi i te nui o te eluent (40 µl).
I kitea ano e o maatau hua ko te mahi kitenga o te whakamatautau ira a Daan he rite tonu ki ta CRS. E rite ana tenei ki te rangahau14 i whakahaeretia i te Whare Wananga o Anhui i Huainan, Haina, me te kerēme a te kaihanga mo te 100% pai te whakaaetanga. Ahakoa nga purongo o nga hua riterite, kotahi te tauira he kino kino i muri i te whakamatautau ano i te ruate ano, engari he pai i roto i nga whakamatautau Abbott SARS-CoV-2 me Sansure Biotech nCoV-2019. E tohu ana tera pea he rereke nga hua puta noa i nga momo whakamatautau. Heoi ano, i roto i te rangahau i mahia i Haina15, he tino rerekee te hua o te whakamatautau a Daan Gene (p <0.05) ki te whakatauritea ki ta raatau whakamatautau tohutoro kua tautuhia e te taiwhanga. Heoi ano, i roto i te rangahau i mahia i Haina15, he tino rerekee te hua o te whakamatautau a Daan Gene (p <0.05) ki te whakatauritea ki ta raatau whakamatautau tohutoro kua tautuhia e te taiwhanga. Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (p < 0,05) тлоблот эталонного анализа. Heoi, i roto i te rangahau i Haina15, he tino rerekee te hua tātaritanga a Daan Gene (p <0.05) mai i ta raatau tātaritanga tohutoro taiwhanga.然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异（p <0.05）然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测眾<0.05 Однако в исследовании, проведенном в Китае15, результаты генетического теста Daan значительно отличались (p) < 0,0,0 эталонным лабораторным тестом. Heoi, i roto i te rangahau i Haina15, he tino rerekee nga hua o te whakamatautau ira a Daan (p <0.05) ki tana whakamatautau taiwhanga tohutoro.Ko tenei rereketanga na te kaha o te whakamatautau tohutoro kia kitea te SARS-CoV-2, a he mea nui ano etahi atu rangahau hei whakatau i te take.
I tua atu, i arotakehia e ta maatau rangahau nga mahi whakatairite o te SARS-CoV-2 BGI assay me CRS, e whakaatu ana i te pai o te pai o te whakaaetanga paihēneti (PPA = 97.9%), te whakaaetanga ōrau tōraro (NPA = 100%), me te katoa o te ōrau whakaaetanga mā te ira tangata ( OPA). ). = 98.8%). Ko nga uara Kappa a Cohen i whakaatu pai te whakaaetanga (K = 0.975). Ko nga rangahau i roto i te Netherlands16 me Haina15 kua kitea nga hua rite. Ko te whakamatautau SARS-CoV-2 BGI he ira kotahi (ORF1a/b) te whakamatautau kitenga ma te whakamahi i te 10 µl whakakaha/kitenga eluate. Ahakoa te pai o te whakaaetanga tauanga me o tatou hua tohutoro, i ngaro te tātaritanga e rua nga tauira pai (1.22%) o te katoa o te tauira. He nui nga paanga haumanu tenei mo te kaha o te tuku i nga taumata o te manawanui me te hapori.
Ko tetahi atu tātaritanga whakatairite i whakauruhia ki roto i tenei rangahau ko te Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) whakamatautau; ko te 96.3%. Ko te kaha o te whakaaetanga i whakatauhia e te uara Kappa a Cohen, he 0.925, e tohu ana i te tino whakaaetanga me te CRS. Ano, he rite tonu a matou hua ki nga rangahau i whakahaeretia i te Whare Wananga o Central South i Changsha, Haina, me te Tari Taiwhanga Haumanu o te Whare Hauora Tangata o Liuzhou, Liuzhou City, Haina17. Ahakoa i tuhia te pai o runga ake nei, ko te whakamatautau chi-square (MacNemar test) i whakaatu ko te hua o te Sansure Biotech assay he rereke te rereketanga ki te CRS (p <0.005). Ahakoa i tuhia te pai o runga ake nei, ko te whakamatautau chi-square (MacNemar test) i whakaatu ko te hua o te Sansure Biotech assay he rereke te rereketanga ki te CRS (p <0.005). Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (краси) что результат анализа Sansure Biotech имеет статистически значимое различие по сравнению с CRS (p <0,005). Ahakoa i tuhia te whakaaetanga tauanga pai i runga ake nei, ko te whakamatautau chi-square (whakamatautau McNemar) i whakaatu ko te hua o te whakamatautau a Sansure Biotech he rereke te rereketanga o te tatauranga ki te CRS (p <0.005).尽管记录了上述良好的统计一致性，但卡方检验（MacNemar 检验）表明，Sansure Biotech 检浞的结测相比具有统计学显着差异（p < 0.005）。尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致性 ， 但 检验 （（macnemar 检验 表明 ， ， sansure biotech 中文相比 具有 显着 （（p <0.005……….. Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) показал разницу (p < 0,005) между анализом Sansure Biotech me CRS. Ahakoa te pai o te whakaaetanga tauanga kua tuhia i runga ake nei, ko te whakamatautau chi-square (whakamatautau McNemar) i whakaatu i te rereketanga nui (p <0.005) i waenga i te Sansure Biotech assay me te CRS.E ono nga tauira (3.66%) i kitea he kino kino i whakaritea ki te CRS (Ripanga Tāpiri 1); he mea tino nui tenei, ina koa na te kaha o te tukunga o te huaketo. Ko nga raraunga o runga ake nei e tautoko ana i tenei reiti kitenga iti15.
I roto i tenei rangahau, i whakatauhia nga uara Ct mo ia whakamatautau me ia turanga, me te iti rawa o te uara Ct i whakaatuhia i roto i te whakamatautau Abbott SARS-CoV-2. Ko tenei hua ka pa atu pea ki te punaha whakamatautau ira whakakotahi a Abbott mo te kitenga o SARS-CoV-2. No reira, e ai ki te Whakaahua 1, 87.6% o nga hua Abbott SARS-CoV-2 he uara Ct kei raro iho i te 20. He iti noa nga hua tauira (12.4%) kei roto i te awhe 20-30. Ko nga uara Ct kei runga ake i te 30 kaore i tuhia. I tua atu i te whakamahi a Abbott i te whakatakotoranga whakamatautau ira a te roopu SARS-CoV-2, ka pa atu pea tenei hua ki te iti o te teiti kitenga (32.5 kape RNA/mL) 18, e toru nga wa iti iho i te rohe iti o te kamupene o te 100 kape RNA. /mL. ml)19.
He herenga to tenei rangahau: tuatahi, karekau he tikanga paerewa/tohutoro [penei i te uta viral me etahi atu whakamatautau taiwhanga (LDA)] na te kore rawa o nga rauemi. Tuarua, ko nga tauira katoa i whakamahia i roto i tenei rangahau ko te nasopharyngeal swabs, i te mea kaore nga hua e pa ana ki etahi atu momo tauira, me te tuatoru, he iti te rahi o to maatau tauira.
I whakatairitehia e tenei rangahau nga mahi e wha nga whakamatautau rRT-PCR mo SARS-CoV-2 ma te whakamahi i nga tauira nasopharyngeal. He rite tonu te mahinga o nga mahi tirotiro katoa, haunga te whakamatautau a Sansure Biotech. I tua atu, ko te iti o te reeti pai i kitea i roto i te Sansure Biotech assay i whakaritea ki te CRS (p <0.05). I tua atu, ko te iti o te reeti pai i kitea i roto i te Sansure Biotech assay i whakaritea ki te CRS (p <0.05). Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05). I tua atu, ko te whakamatautau a Sansure Biotech he iti te paheketanga o nga hua pai i whakaritea ki te CRS (p <0.05).此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05).此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05). Кроме того, анализ Sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05). I tua atu, he iti ake te reeti pai o te Sansure Biotech ki te CRS (p <0.05).Ko te tātaritanga Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) o PPA, NPA me te whakaaetanga katoa i neke ake i te 93.5% me te uara whakaaetanga o Cohen Kappa he 0.925. Ka mutu, me whai mana te Sansure Biotech Assay (RUO) mo te whakamahi i Etiopia, me whakaaro ano etahi atu rangahau hei arotake i nga kereme mai i nga kaihanga takitahi.
I whakahaerehia te hoahoa rangahau whakatairite i nga whare hauora e wha i Addis Ababa, te Hospital Hospital o Eka Kotebe, Millennium Church Treatment Centre, Zewooditu Memorial Hospital, me St. Peter's Tuberculosis Specialist Hospital. I kohia nga raraunga i waenga i te Hakihea 1 me te 31, 2020. Ko nga whare rongoa mo tenei rangahau i tino whiriwhiria i runga i te maha o nga keehi me te waatea o nga whare rongoa nui i te taone nui. Waihoki, ko nga taputapu, tae atu ki nga taputapu PCR ABI 7500 me Abbott m2000, i tohua kia rite ki nga taunakitanga a nga kaihanga reagent NAAT, a e wha nga kete rapu PCR i tohua mo tenei rangahau, na te nuinga o nga taiwhanga i Etiopia i whakamahi i te iti rawa. tokowha o ratou. Te whakamatautau ira, te whakamatautau Abbott SARS-CoV-2, te whakamatautau Sansure Biotech, me te whakamatautau SARS-CoV-2 BGI i mahia i te wa o te ako).
Ko nga whakamatautau mo te SARS-CoV-2 i mahia mai i te 1 ki te 30 Hakihea 2020 ma te whakamahi i te 3 ml o Viral Transport Medium (VTM) (Hangarau Miraclean, Shenzhen, Haina) mai i nga tangata e tirotirohia ana mo COVID-19 i tukuna ki te EPHI. I kohia nga tauira nasopharyngeal e nga kaikohi tauira kua whakangungua, ka tukuna ki te EPHI i roto i nga kete toru. I mua i te wehenga waikawa karihi, ka whakawhiwhia ki ia tauira he tau tautuhi ahurei. Ka mahia te tangohanga mai i ia tauira i te taenga mai ma te whakamahi i nga tikanga tangohanga a-ringa me te aunoa. No reira, mo te tangohanga aunoa o Abbott m2000, ko te 1.3 ml (tae atu ki te 0.8 ml te ruri mate me te 0.5 ml te tango i te rōrahi uru) o te tauira i tangohia mai i ia tauira ka haere ki roto i te Abbott DNA Sample Preparation System (Abbott Molecular Inc. des Plaines, IL, USA). ) He puranga 96 [92 tauira, e rua nga mana tirotiro me nga mana kore-tauira (NTC)] i whakauruhia ki roto i te mahinga katoa (tango me te rapu) o nga rauna e rua o SARS-CoV-2 (EUA) i te waa tuuturu. maina. Waihoki, mo te tangohanga a-ringa, whakamahia nga tauira rite (mo te tango aunoa me te kitenga). No reira, puta noa i te tukanga, 140 µl tauira i tohatohahia ka tangohia ma te whakamahi i te QIAamp Viral RNA Mini Kit (QIAGEN GmbH, Hilden, Tiamana) i roto i nga roopu 24 (tae atu ki nga tauira 20, e rua nga mana whakamatautau me nga NTC e rua) mo nga rauna e iwa. I whakakahangia, ka kitea ma te whakamahi i te ABI 7500 waiariki e whakamahi ana i te SARS-CoV-2 BGI assay, Daan Gene assay, me te Sansure Biotech assay.
Ko te wehenga aunoa me te purenga o te SARS-CoV-2 viral RNA e whai ana i te maapono pirepire autō ma te whakamahi i nga reagents whakarite tauira Abbott DNA. Ko te whakakore i nga tauira me te whakamaaramatanga o nga matūriki viral ka mahia ma te whakamahi i te horoi horoi kei roto i te guanidine isothiocyanate hei whakakore i te pūmua me te whakakore i te RNase. Ka wehea te RNA mai i te pūmua ma te wehe i te wahanga totoka ma te whakamahi i te silica, ara ko te tote guanidinium me te pH kawakore o te parepare lysis e whakatairanga ana i te herenga o nga waikawa karihi ki te silica (SiO2). Ko te taahiraa horoi ka tango i te toenga o nga pūmua me nga otaota kia puta he otinga maamaa. Ko te RNA puata ka wehea mai i nga maariki moroiti-a-silica ma te whakamahi i te papa autō o te taputapu20,21. I tetahi atu taha, ko te wehenga a-ringa me te purenga o te RNA ka mahia ma te tikanga pou hurihuri ma te whakamahi i te centrifugation hei utu mo te tuunga autō me te wehenga o nga microparticles mai i te eluent.
Ko te Abbott Real-Time SARS-CoV-2 Detection Test (Abbott Molecular, Inc.) i mahia i runga i nga tohutohu a te kaihanga, i whiwhi EUA19,22 mai i te WHO me te FDA. I roto i tenei kawa, ko te whakakore i te tauira i mua i te tangohanga i mahia i roto i te pati wai i te 56 °C mo te 30 min. I muri i te korenga o te huaketo, ka mahia te tangohanga waikawa karihi ki runga i te taputapu Abbott m2000 SP mai i te 0.5 ml VTM ma te whakamahi i te punaha whakarite tauira DNA Abbott m2000. e ai ki te kaihanga. I mahia te whakanui me te rapunga ma te whakamahi i te taputapu Abbott m2000 RT-PCR, a ka mahia te kitenga rua mo nga ira RdRp me N. ROX) me te VIC P (waikano rangatira) mo te whainga me te kite i nga mana o roto, e taea ai te kimi tukutahi o nga hua whakakaha e rua 19 .
Ko te tikanga rapunga whakakaha o tenei kete kei runga i te hangarau RT-PCR kotahi-taahiraa. Ko nga ira ORF1a/b me te N i tohua hei rohe tiaki e Daan Gene Technology hei kite i te whakanuinga o te rohe. Ko nga tohu tuatahi me nga rangahau rewharewha (N nga rangahau ira kua tapaina ki te FAM, nga tirotiro ORF1a/b kua tapaina ki te VIC) kua hangaia kia kitea te SARS-CoV-2 RNA i roto i nga tauira. I whakaritea te rewa whakamutunga me te ranunga matua ma te taapiri i te 5 µl o te eluent ki te 20 µl o te ranunga matua ki te rōrahi whakamutunga o te 25 µl. Ko te whakakaha me te rapunga i mahia i te wa kotahi i runga i te taputapu PCR ABI 750024 moo tonu.
I kitea nga ira ORF1a/b me N ma te whakamahi i te Sansure Biotech nCoV-2019 Nucleic Acid Diagnostic Kit (te kitenga PCR fluorescent). Whakaritehia nga rangahau motuhake mo ia ira e whai ana ma te kowhiri i te hongere FAM mo te rohe ORF1a/b me te hongere ROX mo te ira N. Ki tenei kete whakamatautau, ka taapirihia nga reagents eluent and master mix reagents e whai ake nei: whakarite 30 µl master mix reagent me te 20 µl tauira eluted mo te kimi/whakanui. I whakamahia te PCR ABI 750025 mo te whakakaha/kitenga.
Ko te whakamatautau SARS-CoV-2 BGI he kete rRT-PCR whiti mo te tohu mate COVID-19. Ko te rohe whainga kei roto i te rohe ORF1a/b o te genome SARS-CoV-2, he tikanga kimi ira kotahi. I tua atu, ko te ira tiaki whare tangata ko β-actin he ira whainga a-roto. Ka mahia te ranunga matua ma te whakaranu i te 20 µl o te reagent ranunga matua me te 10 µl o te tauira RNA kua tangohia ki roto i te pereti puna26. I whakamahia he taputapu PCR ABI 7500 fluorescent ine-wa-tu mo te whakakaha me te rapu. Ko nga whakakaha waikawa karihi katoa, nga tikanga whakahaere PCR mo ia whakamatautau, me te whakamaoritanga o nga hua i mahia i runga i nga tohutohu a te kaihanga (Ripanga 3).
I roto i tenei tātaritanga whakatairite, kaore matou i whakamahi i te tikanga paerewa tohutoro ki te whakatau i te ōrau whakaaetanga (te pai, te kino, me te katoa) me etahi atu tawhā whakatairite mo nga tātaritanga e wha. Ko ia whakataurite whakamatautau i mahia ki te CRS, i roto i tenei rangahau i whakatauhia te CRS e te ture "tetahi pai" ka whakatauhia te hua, ehara i te whakamatautau kotahi, i whakamahia e matou nga hua whakamatautau e rua neke atu. I tua atu, i roto i te take o te tuku COVID-19, he kino ake nga hua kino kino atu i nga hua pai teka. No reira, kia tika te kii "pai" mai i te hua CRS, kia rua nga whakamatautau whakamatautau me pai, ko te tikanga ka puta mai i te whakamatautauranga EUA kia kotahi te hua pai. No reira, i roto i nga hua whakamatautau e wha, e rua, neke atu ranei nga hua whakamatautau ka rite nga hua ka kiia he pai, he kino ranei18,27.
I kohia nga raraunga ma te whakamahi i nga puka tangohanga raraunga hanganga, te whakauru raraunga me te tātari i mahia ma te whakamahi i te rorohiko tatauranga Excel me te SPSS putanga 23.0 mo nga tatauranga whakaahua. I tātarihia te pai, te kino, me te ōrau whānui o te whakaaetanga, ā, i whakamahia he kaute Kapa hei whakatau i te tohu whakaaetanga o ia tikanga ki te CRS. Ko nga uara Kappa ka whakamaori penei: 0.01 ki te 0.20 mo te whakaaetanga ngawari, 0.21 ki te 0.40 mo te whakaaetanga whanui, 0.41-0.60 mo te whakaaetanga ngawari, 0.61-0.80 mo te whakaaetanga nui me te 0.81-0.99 mo te whakaaetanga katoa28.
I whakawhiwhia mai te whakamohiotanga matatika mai i te Whare Wananga o Addis Ababa me nga kawa whakamatautau katoa mo tenei rangahau i whakaaetia e te Poari Arotake Matatika Putaiao a te Etiopian Public Health Institute. Ko te nama tohutoro mo te Raihana Matatika EPHI ko EPHI/IRB-279-2020. I whakamahia nga tikanga katoa i runga i nga tohutohu me nga whakaritenga o nga Aratohu Matatini a-Motu o Etiopia mo te maimoatanga o COVID-19. I tua atu, i whiwhi whakaaetanga i tuhia mai i nga kaiuru ako katoa i mua i te whakauru ki te ako.
Ko nga raraunga katoa i whiwhihia, i wetewetehia ranei i roto i tenei rangahau kua whakauruhia ki tenei tuhinga kua whakaputaina. Ko nga raraunga e tautoko ana i nga hua o tenei rangahau ka waatea mai i te kaituhi i runga i te tono tika.
Whakahaere Hauora o te Ao. Nga Tohutohu mo nga Rautaki Whakamatau Taiwhanga mo COVID-19: Arataki Takiwa, Maehe 21, 2020 Nama WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (WHO, 2020).
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 tātaritanga atamai i roto i te Tari ohorere: Katoa-i roto i te Parakatihi. Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 tātaritanga atamai i roto i te Tari ohorere: Katoa-i roto i te Parakatihi.Muliou, DS, Pantazopoulos, I. me Gurgulianis, KI Maaramatanga mohio o COVID-19 i roto i te tari ohorere: nga mea katoa i roto i te mahi.Muliou DS, Pantazopoulos I. me Gurgulyanis KI Maaramatanga mohio o COVID-19 i roto i nga tari ohorere: te whakauru mutunga-ki-te-mutunga i roto i te mahi. Tohunga Reverend Respire. rongoa. 3, 263–272 (2022).
Mitchell, SL & St George, K. Aromātai o te COVID19 ID NOW EUA whakamātautau. Mitchell, SL & St George, K. Aromātai o te COVID19 ID NOW EUA whakamātautau.Mitchell, SL me St. George, K. Aromātai o te COVID19 ID NOW EUA whakamatautau.Mitchell SL me St. George K. Aromātai o te COVID19 ID NOW EUA whakamātautau. J. Haumanu. Virus. 128, 104429. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
WHO. Te rangahau taiwhanga mo te mate coronavirus 2019 (COVID-19) i roto i nga mate tangata e whakapaehia ana. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (i toro atu i te 15 Akuhata 2020) (WHO, 2020).
Udugama, B. et al. COVID-19 Tātaritanga: Nga mate me nga Utauta Whakamatau. ACS Nano 14(4), 3822–3835 (2020).
Syed S. et al. Te whakaturanga o te Kaareti o nga Kairangahau o te Rawhiti, Te Waa me te Tonga o Awherika - Te Kura a-Rohe mo te Pathology o te Middle East me Awherika ki te Tonga. Āwherika. J. Lab. rongoa. 9(1), 1-8 (2020).
Te Whare Taonga o te Hauora o Etiopia, Te Manatu Hauora a te Federal. Te Rautaki Motu me te Arataki mo te Taatauranga Taiwhanga mo COVID-19. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (i toro atu i te 12 Akuhata 2020) (EPHI, 2020).
Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS Nga whakamatautau kino kino mo nga wero me nga paanga o te mate SARS-CoV-2. Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS Nga whakamatautau kino kino mo nga wero me nga paanga o te mate SARS-CoV-2.Voloshin S., Patel N. me Kesselheim AS He whakamatautau-kino mo nga mate SARS-CoV-2 me o raatau hua.Voloshin S., Patel N. me Kesselheim AS He whakamatautau kino-kore mo te whakapataritari me te paanga o te mate SARS-CoV-2. N. eng. J. Rongoa. 383(6), e38 (2020).
Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Nga keehi COVID-19 he pai-te-tika me te teka-kino: Nga rautaki aukati me te whakahaere i te manawa, te werohanga, me etahi atu tirohanga. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Nga keehi COVID-19 he pai-te-tika me te teka-kino: Nga rautaki aukati me te whakahaere i te manawa, te werohanga, me etahi atu tirohanga. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Ложноположительные и ложноотрицательные случаи COVID-19: респираторная профилактика и стратегии, леикиця дальнейшие перспективы. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Nga keehi pai me nga keehi kino teka o COVID-19: nga rautaki aukati manawa me te maimoatanga, kano kano me te huarahi whakamua.Muliu, DS me Gurgulianis, KI Ko nga keehi he pai me te kino-kore o COVID-19: nga rautaki mo te aukati manawa me te maimoatanga, te werohanga me te huarahi whakamua. Tohunga Reverend Respire. rongoa. 15(8), 993–1002 (2021).
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. COVID-19 tātaritanga i roto i te tari ohorere: Ka kite i te rakau engari ka ngaro te ngahere. Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. COVID-19 tātaritanga i roto i te tari ohorere: Ka kite i te rakau engari ka ngaro te ngahere.Mouliou, DS, Ioannis, P. and Konstantinos, G. COVID-19 Diagnosis i roto i te Tari ohorere: Tirohia te rakau, ngaro te ngahere.Muliou DS, Ioannis P., and Konstantinos G. COVID-19 Diagnosis i roto i nga ruma ohorere: Kare i Raka te Ngahere mo nga Rakau. Ka puta. rongoa. J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
Degli-Angeli, E. et al. Te Whakamana me te Whakamana i nga Mahi Taatari me te Haumanu o te Abbott RealTime SARS-CoV-2 Assay. J. Haumanu. Virus. 129, 104474. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Whakatauritehia nga huinga tuatahi e rima mai i nga rohe momo momo o COVID-19 mo te kite i te mate huaketo ma te RT-PCR tikanga. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Te whakataurite o nga huinga tuatahi e rima mai i nga rohe ira momo rereke o COVID-19 mo te kite i te mate huaketo ma te RT-PCR tikanga.Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. me Aflatunyan, B. Whakatauritenga o nga huinga e rima o nga mea tuatahi mai i nga rohe rereke o te COVID-19 genome mo te kite i te mate huaketo ma te RT-PCR tikanga. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. 比较来自COVID-19不同基因组区域的五个引物组，用于通过常规RT-PCR 检测病毒感染。 Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Whakatauritenga o nga rohe ira rereke e 5 o COVID-19 mo te kite i te mate huaketo ma te RT-PCR tikanga.Mollaei HR, Afshar AA, Kalantar-Neyestanaki D, Fazlalipour M. me Aflatunyan B. Te whakataurite o nga huinga e rima o nga mea tuatahi mai i nga rohe rereke o te COVID-19 genome mo te kite i te mate huaketo ma te RT-PCR tikanga.Iran. J. Microbiology. 12(3), 185 (2020).
Goertzer, I. et al. Nga hua tuatahi o te kaupapa aromatawai kounga o waho o te motu mo te kitenga o nga raupapa ira ira SARS-CoV-2. J. Haumanu. Virus. 129, 104537. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020).
Wang, M. et al. Aromātai tātaritanga o te whaihuatanga o nga kete RT-PCR e rima mo te mate kino o te mate manawa whakakaha Coronavirus 2. J. Haumanu. taiwhanga. nono. 35(1), e23643 (2021).
Wang B. et al. Aromātai o nga kete rapunga RNA SARS-CoV-2 e whitu e waatea ana i Haina i runga i te tauhohenga mekameka polymerase (PCR). haumanu. Te matū. taiwhanga. rongoa. 58(9), e149–e153 (2020).
van Casteren, PB et al. Te whakatairitetanga o nga kete tātari RT-PCR COVID-19 arumoni e whitu. J. Haumanu. Virus. 128, 104412 (2020).
Lu, Yu, et al. Te whakatairite i nga mahi tātaritanga o nga kete PCR e rua mo te kitenga o nga waikawa karihi SARS-CoV-2. J. Haumanu. taiwhanga. nono. 34(10), e23554 (2020).
Lefart, PR, me etahi atu. Ko te rangahau whakatairite mo nga papahanga whakakaha waikawa karihi e wha SARS-CoV-2 (NAAT) i whakaatu ko te mahi a ID NOW i tino whakahekehia i runga i te ahua o te manawanui me te momo tauira. tātaritanga. microbiology. Te pangia. diss. 99(1), 115200 (2021).
Abbott rāpoi ngota. Abbott wa-tūturu te whakauru kete tātari SARS-CoV-2. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay. 1-12. (No te 10 o Akuhata 2020) (2020).
Klein, S. et al. Ko te wehenga o te SARS-CoV-2 RNA ma te whakamahi i nga pirepire autō mo te kitenga nui-nui e RT-qPCR me RT-LAMP. Virus 12(8), 863 (2020).